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martes, 25 de agosto de 2015

Ejemplo de una gráfica deficiente en reportes cientificos

Realizar gráficas claras y precisas es un deber para todo comunicador de ciencia: reportero o investigador. Pues el lenguaje visual, cuando es bien utilizado, es rápido e impactante. En anteriores entradas he platicado de 10 reglas para hacer buenas gráficas; así también mostré un ejemplo más general sobre el asunto.

Pues bien me encontré con esta imagen de... Anónimo. Esta imagen se puede mejorar mucho, especialmente por un estudiante de ciencias/ingeniería, de modo que la gráfica nueva  brinde información, no distraiga y diga la verdad. Sí, como recomienda E. Tufte.

Esta gráfica se puede mejorar mucho para que comunique
su mensaje con eficiencia e impacto. Autor: Anónimo. ;) 

1) Siempre presenta los puntos experimentales. Puntos experimentales deben marcarse como puntos, no como una linea continua :(  La linea continua puede acompañar a los puntos, que deberian siempre estar presenta. En ocasiones tenemos tantos puntos experimentales, que forman la linea.

2) La lineas base (ejes), los números y las etiquetas de los ejes deben resaltar más. De lo contrario se pierden fácilmente en toda la imagen. Por ello, hay que retirar la cuadricula del interior de la imagen, la cuadricula distrae.

3) Cuida las faltas de ortografia, en los documentos formales debemos cuidar más la ortografia (Pues que no es un blog (LOL) ). La palabra "Angulo" le falta el acento en la primera palabra. Por eso debemos apoyarnos de alguien que busque este tipo de errores antes que los señale un evaluador estricto... si como tu profesor.

4) Marca los puntos importantes. Cuando presentes gráficas es que mostraras tendencias, pero también las cifras importes. Entonces no dejes escapar esa información.

5) Deja en claro que significan las lineas. Para eso se colocan las etiquetas señalando a las líneas. ¿La linea recta representa una regresión de datos o un modelo teórico?

Se trata de aprender del ejemplo, incluso del mal ejemplo. Se trata de ver estos gráficos para mejorar los nuestros. Se trata de hablar de las ideas y como expresarlas mejor, el resto... el resto no es tema de este blog.

5 ejemplos sencillos sobre la correlación y ajuste de líneas, con Excel.

Todos los que nos dedicamos a presentar información por medio de gráficos debemos dominiar el ajuste de curvas a una serie de datos, este post es un comentario sobre la relación de la correlación a los ajustes de líneas rectas.

Cuando hacemos un experimento lo mejor es sólo variar una variable y observar una sola respuesta a ese estimulo. Después, debemos presentar esos datos en un gráfico y buscar una ecuación matemática que nos permita extraer la información de comportamiento que observamos y predecir otros casos.

Pues bien, para mostrar la relación entre la correlación de datos experimentales (que aquí llamamos R cuadrada) y los puntos obtenidos por un ajuste de datos (como es el método de mínimos cuadrados), les presento 5 ejemplos básicos de cómo funciona.

Por ser muy popular, emplee Excel para hacer los gráficos y simulaciones numéricas. 

Caso 1. En una columna hice una serie de números que varían linealmente 1:1:20, y los grafique contra su clon. Por medio de botones alternos, Excel puede desplegar líneas de tendencia, la ecuación de ajuste y el factor R^2 para que se muestre en el gráfico. En este y los otros casos escogimos un ajuste lineal pues este es un ejemplo introductorio y porque la regresión lineal es el modelo matemático muy fácil de interpretar desde el punto de vista físico.

El resultado es una línea que empata con todos los puntos experimentales (que nosotros creamos ;) ), por lo cual el factor R^2 es 1. R^2 es un índice normalizado, de intervalo de 1 a 0, el 1 significa que nuestra elección de ajuste es adecuado, mientras que el 0 representa un pésimo ajuste. Como veremos en este post, es cuestión de criterio que ajuste emplear.


Caso 2. A cada uno de los datos de respuesta originales les he sumando un número aleatorio, use una función propia de Excel que genera los números aleatorios entre 0 y 1. Al obtener la línea de tendencia, observamos que no todos los puntos empatan en los puntos, eso era lo que esperábamos. Por lo cual, efectivamente el factor R^2 disminuyo hasta 0.9981, lo que significa que es una alta correlación, por lo cual el ajuste sigue siendo adecuado pese al ruido presente.


Caso 3. Ahora aumente el nivel de ruido, mulliqué la función aleatoria por 10 y la sume a los datos lineales. El resultado es una mayor dispersión de los puntos, por lo cual la correlación del ajuste lineal disminuyo hasta 0.7859; en estas condiciones este ajuste es muy pobre, incluso se puede pensar en desecharlo.



 


Caso 4. Ahora bien, como tenemos información previa sobre el origen de los datos (como en todo experimento bien planeado), sabemos que el ajuste debe ser lineal, que algunos datos están demasiado alejados de la línea de tendencia; por lo cual, aplicaremos un criterio para eliminar los datos que más se alejan de la línea de tendencia, en este caso el criterio fue tomar a los más alejados a golpe de vista (pues este es un ejemplo didáctico :) ). Esto solo lo puedo hacer si cuento con varios puntos y si confío en el ajuste originalmente elegido. Me quede con 11 datos y obtengo una mejora en el R^2 de 0.7792 a 0.952. Eliminar datos outliers es válido, especialmente si se sistematiza; lo que no es válido es alterar o añadir puntos a conveniencia y sin avisar a quien recibe la información (eso es engañar).

Caso 5. Mejorar la R^2 es solo un criterio para hacer adecuados ajustes de líneas, para nada es una regla increbrantable. Un ejemplo claro es una serie de datos de respuesta que siguen una parábola. Cuando aplicamos una lineal de tendencia obtenemos una R^2 = 0.9435 lo cual es una buena correlación; sin embargo, como sabemos el origen de estos puntos numéricos, es un ajuste equivocado. Lo cual es claro cuando empleando las funciones de Excel ajustamos a una parábola y aumentamos la correlación hasta 1, el valor máximo que se puede obtener.


Conclusión. El factor de correlación entre ajuste de curvas y datos experimentales nos da información sobre lo certero que puede ser el modelo, pero solo es un criterio, que se debe complementar con otra información previa, calculada o inferida.

Actividad sugerida:
Puedes hacer tus propios experimentos numéricos con el archivo original que hice, puedes trabajarlo desde Google Docs. Y recuerda déjanos tus comentarios para mejorar este post que tanta ayuda necesita.

Links de interé:
¿Qué tan bueno es un ajuste? (ingles), para ser más formales sobre el significado de R^2.

martes, 12 de agosto de 2014

Actividad en el laboratorio , Sesión 1

Por González García Gerardo

La primera sesión de laboratorio de óptica se dedicó a calcular el índice de refracción de dos materiales: vidrio y acrílico.

Los estudiantes trabajando
Primero se realizó el montaje del dispositivo; se colocó un microscopio viajero en posición vertical, con el fin de poder observar un objeto colocado debajo del microscopio. Después se dibujó una marca pequeña en un trozo de papel, cuidando que la hoja no sufriera deformaciones y se mantuviera con una forma plana. Luego, se colocó una lámpara en el ocular del microscopio para que la luz indicara la posición a la cual apuntaba y de esta manera se pudiera acomodar la marca de una manera sencilla. Después, se enfocó la marca deslizando el tubo del ocular a través de su recorrido vertical (tratando de deslizar lentamente el tubo), al enfocar la marca, se tomó la primera medición mediante el nonio del microscopio.

Posteriormente se colocó un disco de acrílico encima del papel con la marca, nuevamente se enfocó la marca vista a través del material y se volvió a tomar la posición marcada en el nonio.

Por último se colocó un segundo papel con una marca (idéntico al primero) encima del disco de acrílico, de igual manera se trató de enfocar la marca de este nuevo papel y se marcó la posición.

Este proceso se repitió diez veces para este material y se realizó lo mismo con el vidrio. Para calcular el índice de refracción, se utilizó el cociente entre dos diferencias; en el numerador se tomó el valor absoluto de la primera medición menos la tercera y en el denominador se tomó el valor absoluto de la segunda medición menos la tercera. Por último se realizó un promedio entre los índices de refracción.

martes, 5 de agosto de 2014

Bienvenidos estudiantes de laboratorio de óptica 2014

Manos a la obra para nuestro trabajo dentro del laboratorio, ya pueden consultar el documento para utilizar el microscopio viajero y medir indice de refracción.

Recuerden: en un mes, el 4 de septiembre, entregan su proyecto. ¿Cuál es el mejor método para medir el índice de refracción en sólidos?

Y para ser tan claro como el agua. 50% es el trabajo del laboratorio, y 50% son los proyectos.

Sí tenemos tiempo, realizaremos la medición por el método de PFund. Deben de llegar al laboratorio con estas dos partes bien leídas.

Por cierto, los inscritos deberan de llenar este e-cuestionario para hacer nuestra base de datos.

Sí hay dudas, pregunten.

¡Valor y confianza, muchachos!



miércoles, 8 de agosto de 2012

Trabajo 1: medición del indice de refracción por medio de tres diferentes procedimientos

Foto de nuestra lucita de laboratorio
Lean bien el documento de introducción a nuestro primer trabajo de laboratorio antes de comenzar la clase. Este trabajo consiste  en medir el indice de refracción n de la lucita (o material plástico que les den en el laboratorio)  por medio de tres diferentes técnicas:

1) Medición  de n por método de Pfund, que se basa en el efecto de ángulo critico, en un haz láser esparcido (scattering effect) por una delgada hoja de papel. Pueden consultar más información de este efecto en el poster dentro de la página web del AAPT.

2) Medición de n midiendo la profundidad real y aparente de imágenes de microscopio viajero.

3) Medición de n midiendo el desplazamiento de un haz láser en función de angulo de incidencia en un bloque de lucita.

Cuiden que en sus experimentos la luz del láser no llege directamente a los ojos, y recuerden que sus datos nos serán útiles para futuros experimentos.

Por cierto, ¿en qué más les puedo ayudar para hacer eficiente la clase?

Información adicional:



miércoles, 25 de abril de 2012

Demostraciones que hemos realizado en el laboratorio de óptica

Esta es una lista que estaré actualizando a lo largo del curso, sirve de control pero también de recordatorio de que nos falta realizar. La meta es alcanzar 50 demostraciones, algunas están incluidas en su trabajo de investigación que deben reportar en el laboratorio.

Óptica Geométrica
  1. Anamorfismos (PENDIENTE)
  2. Profundidad aparente, lo hicimos mediante el microscopio viajero.
  3. Prueba de Pfund
  4. Desviación de un haz láser en una placa de caras paralelas.
  5. Pecera con gradiente de indice de refracción 
  6. Chorrito de agua como guia de onda
  7. Dispersión de un prisma, obtención del espectro de una fuente de luz blanca, de fuentes de elementos y láser.
  8. Formación de imagenes Schlieren, shadow-grafia
  9. Construcción de un telescopio con lentes
  10. Construcción de un microscopio 
Óptica Física
  1. Radiometro
  2. Obtención del ángulo de Brewster
  3. Medición del índice de refracción por medio de haces polarizados P y S en una muestra a 45 grados.  
  4. Polarización de microondas y rejilla metálica
  5. Polarización lineal por esparcimiento (scattering
  6. Ley de Malus (relación Polarzador/Analizador), el polarizador como filtro pasivo (usando un láser, y luego una lampara convencional)
  7. Polarizadores lineales como operadores/trasformadores de señal óptica (Polarizador/Operador/Analizador)
  8. Birrifrigencia de una calcita
  9. fotografías de fotoelasticidad de plástico corriente
  10. Actividad óptica de materiales orgánicos (PENDIENTE) 
  11. Difracción óptica de una rendija y un cabello
  12. Difracción 2D de arreglos varios: cuadrados, hexagonos, etc.
  13. Obtención de un punto de Poisson
  14. Interferometro de Michelson: anillos y franjas de interferencia. Franjas de interferencia con luz blanca
  15. Interferometro de Fabry-Perot
  16. Patrones de Moire
¿Qué me otra demostración me falta mencionar?

Tal vez les podamos ganar en el número de demostraciones a los chicos de Harvard. ;)

domingo, 29 de enero de 2012

Actividad: Cuestionario 1, sobre nuestra primer sesión de trabajo

Instrucciones: debes contestar clara y brevemente todas las preguntas de este cuestionario sobre nuestras primeras actividades en el laboratorio. debes contestarlo antes del viernes 3 de febrero.

Recuerda que estas preguntas se basan en documento de nuestro trabajo núm. 1, el cual ya debiste haber leido antes de nuestra primera sesion de trabajo.